全自动抛光机操作的关键是寻求更高的抛光速率，以便尽快去除抛光过程中产生的损伤层。同时，磨料损伤层不应影响观察到的组织。也是说，它不应该导致虚假组织。前者需要使用较粗的磨料来保证较高的抛光速度以去除磨料损伤层，但也会加深磨料损伤层。后者需要使用更精细的材料，使抛光损伤层更浅，但抛光速率较低。全自动抛光机解决这一矛盾的方法是将研磨分为两个阶段。以下是操作自动抛光机的一些技巧。
1、为了尽快去除抛光过程中产生的损伤层，请提高全自动抛光机的抛光速度。

2、防止打磨后的破损层影响观察到的组织。也是说，它不会导致假组织。

3、解决这个矛盾的办法是把自动磨床分成两个层次。

4、粗抛的目的是去除打磨过的损伤层，达到较大的抛光速度。

5、粗抛造成的表面损伤是次要的考虑，但也应尽可能小。

6、精抛，其目的是去除粗抛造成的表面损伤，稍微减少抛光损伤。